Année 2199, l'humanité vit ses derniers jours. La puissante flotte de la
planète Gamilas déclenche une avalanche d’astéroïdes radioactifs qui s’abattent
sans relâche sur la Terre, rendant la planète inhabitable. Les survivants
de cette expérience atroce se sont réfugiés dans de vastes cités souterraines,
mais la contamination radioactive s'enfonce toujours plus profondément. Il n'y
aura bientôt plus de refuge possible pour l'espèce humaine, l’extinction est proche.
A ce même moment, une terrible bataille fait rage aux alentours de Pluton, celle-ci
engage la flotte gamilienne et la Force de Défense Terrienne emmenée par le capitaine
Jyuzo Okita.
Alors que la situation se complique pour l’armée terrienne, elle reçoit
du haut-commandement l’ordre d’un repli immédiat. Refusant cet ordre de retraite,
le jeune officier Mamoru Kodai disparaît tragiquement au cours de la bataille.
Pendant ce temps, de l’autre côté de la galaxie, deux jeunes recrues en mission
d'observation sur Mars, les dénommés Susumu Kodai et Daisuke Shima, sont envoyées
sur les lieux du crash d'un vaisseau extra-terrestre non identifié. Ils y découvrent
le corps sans vie d'une jeune femme blonde tenant dans sa main une capsule pour le
plus suspecte...
