Après avoir vu le système solaire détruit par des extraterrestres
appelés « Gauna », il y a mille ans de cela, les rescapés furent
contraints à l'exil dans les vastes confins de l'univers, à la recherche d'une
nouvelle "Terre". Toutefois, la guerre contre les Gaunas qui perdure
depuis 1000 ans et aujourd’hui encore obligent les Humains à trouver un moyen
efficace pour les éliminer définitivement. Ils traversent alors l’espace intersidéral à
bord de plusieurs vaisseaux, dont le "Sidonia". Le Sidonia est le bijou de la flotte
spatiale humaine, il est à la fois une maison et un vaisseau de combat. Armé de canons
lumineux, d'une barrière magnétique et d’une puissante armada de Sentinelles, il
est l'arme ultime dans la guerre qui oppose Humains et Gauna.
